RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2E1P51965 193 aa20.69■□□□□ 0.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-201ENST00000246533 AJUBAQ96IF1 538 aa20.69■□□□□ 0.9
CAPNS1-201ENST00000246533 E7EUB6 86 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-201ENST00000246533 SAA4P35542 130 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-201ENST00000246533 LEMD1Q68G75 181 aa20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATOH7Q8N100 152 aa20.68■□□□□ 0.9
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4F17Q8NGA8 305 aa20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 DYNAPQ8N1N2 210 aa20.64■□□□□ 0.89
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DRB1P01911 266 aa20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-59P01825 116 aa20.59■□□□□ 0.89
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV1-47P01700 117 aa20.58■□□□□ 0.88
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CAPNS1-201ENST00000246533 GATD1Q8NB37 220 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPHD1Q5U4P2 390 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 Q86TA4 180 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA12Q7Z6I5 190 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TENM1Q9UKZ4 2725 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PMCHL2Q9BQD1 86 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RPH3ALQ9UNE2 315 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-48P01763 117 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PCP4P48539 62 aa20.55■□□□□ 0.88
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