RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481		Q8N9W7	124 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NDP	Q00604	133 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NIT1	Q86X76	327 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	PYY	P10082	97 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	MFAP2	P55001	183 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SPATA45	Q537H7	98 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	TSKU	Q8WUA8	353 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	BORCS7	Q96B45	105 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	C3orf79	P0CE67	100 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	UBE2G1	P62253	170 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	FOXC2	Q99958	501 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481		H3BUX3	64 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SLA	Q13239	276 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NUP35	Q8NFH5	326 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	HYPM	O75409	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	FSHB	P01225	129 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	MYCNOS	P40205	109 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2J3	O76001	311 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	LY6E	Q16553	131 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	TRGV9	Q99603	122 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-208	ENST00000638481	NTF3	P20783	257 aa		11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.71	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	CRYGC	P07315	174 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	BATF	Q16520	125 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	HSBP1	O75506	76 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	HIGD1C	A8MV81	97 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	ORM2	P19652	201 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	TFPI2	P48307	235 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	GNG5	P63218	68 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR82	Q96P67	336 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	PGP	A6NDG6	321 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481		A6NDX4	124 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	CORT	O00230	105 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-208	ENST00000638481	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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