RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635841.1

XIST-211, X inactive specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene XIST, Length 1,734 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIST-211ENST00000635841 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.73□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 HELTA6NFD8 242 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 C9JQL5 133 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 M0QZ24 198 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 ATP6V1G1O75348 118 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 FOLR2P14207 255 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 EDN2P20800 178 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 MYCNOSP40205 109 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 ATP5G3P48201 142 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 CD81P60033 236 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 PDE6HQ13956 83 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 C17orf77Q96MU5 243 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 CITED1Q99966 193 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
XIST-211ENST00000635841 A0A087X0K7 114 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 PDE6DO43924 150 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 NDUFB4O95168 129 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SFTA3P0C7M3 94 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 CBLN1P23435 193 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 CEBPGP53567 150 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 Q9H3A6 140 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 VWFP04275 2813 aa6.71□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 PGPA6NDG6 321 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 GGTLC3B5MD39 225 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 F6UZH7 168 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SLC17A3O00476 420 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 OVOL1O14753 267 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 PF4P02776 101 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 MEOX2P50222 304 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 PSG9Q00887 426 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 TCF24Q7RTU0 167 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 OTORQ9NRC9 128 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 TMEM218A2RU14 115 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 TMEM250H0YL14 139 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 ZNF253O75346 499 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 CSN3P07498 182 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 MLXQ9UH92 298 aa6.7□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 LINC00052Q96N35 136 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 NRN1Q9NPD7 142 aa6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 F8W036 122 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 C3orf56Q8N813 242 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 C16orf92Q96LL3 132 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 ZNF747Q9BV97 191 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 EPDR1Q9UM22 224 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.68□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 PEX7O00628 323 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 S100A1P23297 94 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 CSN1S1P47710 185 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 GNG5P63218 68 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 C11orf52Q96A22 123 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SEC11CQ9BY50 192 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 M0R3E3 92 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SAP30O75446 220 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 ID1P41134 155 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 AKR1C3P42330 323 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 TFPI2P48307 235 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 PAFAH1B2P68402 229 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 RNF182Q8N6D2 247 aa6.67□□□□□ -1.34
XIST-211ENST00000635841 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104 ms