RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 BCAP31P51572 246 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CAV2P51636 162 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 GUK1Q16774 197 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZRG5 221 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DEFB4AO15263 64 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 COX7A2P2O60397 106 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 LY6G6CO95867 125 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 INSP01308 110 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 IGLC2P0DOY2 106 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 TSPOP30536 169 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DEFA1P59665 94 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DEFA3P59666 94 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 BAXQ07812 192 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 RAB32Q13637 225 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 OPCMLQ14982 345 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 PSG3Q16557 428 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZTC4 211 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 UHRF2Q96PU4 802 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 ODF3Q96PU9 254 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 APLNQ9ULZ1 77 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 E5RGE8 158 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 F6UB75 175 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CST7O76096 145 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 HBE1P02100 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 RLN2P04090 185 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 S100A10P60903 97 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 IFITM3Q01628 133 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 C12orf74Q32Q52 190 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 ZNF738Q8NE65 137 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DKK2Q9UBU2 259 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CELA1Q9UNI1 258 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 IGSF23A1L1A6 192 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 IGKV3-20P01619 116 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 PET100P0DJ07 73 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DEFB1P60022 68 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 PDE6HQ13956 83 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 RRN3P1Q2M238 152 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 LYRM9A8MSI8 78 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 IGLL5B9A064 214 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CDKN1BP46527 198 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 FGL1Q08830 312 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 RNF182Q8N6D2 247 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 PRELID1Q9Y255 219 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 P0DMU3 169 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 FAM231AP0DMU4 169 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 FAM231CP0DMU5 169 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 FGF7P21781 194 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 FXYD7P58549 80 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 TAS2R60P59551 318 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 MIC13Q5XKP0 118 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 H2BFSP57053 126 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 MORN5Q5VZ52 161 aa6.46□□□□□ -1.38
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