RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARV1Q9H2C2 271 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 NUDT3O95989 172 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP5G1P05496 136 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR4E1P0C645 316 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 HTN1P15515 57 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP5G3P48201 142 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAS2R60P59551 318 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 BAK1Q16611 211 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 FNDC10F2Z333 226 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 K7EPK0 472 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCGB1D2O95969 90 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TEPPQ6URK8 271 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 S100A7AQ86SG5 101 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 C16orf74Q96GX8 76 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CBY3A6NI87 242 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDKN1BP46527 198 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 INPP1P49441 399 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TNP2Q05952 138 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-208ENST00000616074 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 C4orf46Q504U0 113 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIQKQ629K1 86 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF141Q8WVD5 230 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-208ENST00000616074 TSC22D2O75157 780 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARL16Q0P5N6 197 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIR3DS1Q14943 382 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 LCN15Q6UWW0 184 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 C6orf223Q8N319 242 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 C7orf66A4D0T2 115 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRAC2D3DTV9 90 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 H3BTX0 84 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 H7BYZ3 331 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 MORN5Q5VZ52 161 aa14.49□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 C16orf90A8MZG2 172 aa14.48□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 GGACTQ9BVM4 153 aa14.48□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 OPCMLQ14982 345 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SSX7Q7RTT5 188 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CENPXA8MT69 81 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGLC2P0DOY2 106 aa14.46□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 H3BQ15 152 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCSO14618 274 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.45□□□□□ -0.1
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