RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591004.1

SMIM22-208, Transcript of small integral membrane protein 22, human

TSL 3

Gene SMIM22, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMIM22-208	ENST00000591004	FXYD7	P58549	80 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	OXA1L	Q15070	435 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004		H3BTX0	84 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	CXCL2	P19875	107 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	PSG9	Q00887	426 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	DEFB4A	O15263	64 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	PMS2P11	Q13670	270 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	PSG3	Q16557	428 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	HRH4	Q9H3N8	390 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	CXorf65	A6NEN9	183 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004		H3BQ15	152 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	MFF	Q9GZY8	342 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	SLC17A3	O00476	420 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	MIF	P14174	115 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	GUK1	Q16774	197 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004		Q8NAQ8	132 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	WFDC1	Q9HC57	220 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004		X6R8D5	127 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004		Q5BKY6	102 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SMIM22-208	ENST00000591004	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004		A8MTW9	85 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PYY	P10082	97 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	RHOB	P62745	196 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004		M0R2Z0	102 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF253	O75346	499 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	AMBP	P02760	352 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	ZNF266	Q14584	549 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	NUPR2	A6NF83	97 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	OR7C2	O60412	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	NDUFB4	O95168	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	INS	P01308	110 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	OR10J4	P0C629	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PDE6H	Q13956	83 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SMIM22-208	ENST00000591004	NEU1	Q99519	415 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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