RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRX2 142 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 HELTA6NFD8 242 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 GGTLC3B5MD39 225 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 F8W036 122 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CHEK1O14757 476 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SOHLH1Q5JUK2 328 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf91Q5T1B1 145 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00052Q96N35 136 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 OTORQ9NRC9 128 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF785A8K8V0 405 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFB4O95168 129 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf52Q96A22 123 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 Q9H3A6 140 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 JMJD1CQ15652 2540 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 M0QZ24 198 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP10-3P60369 221 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 OR9G4Q8NGQ1 327 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC50A1Q9BRV3 221 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 PGPA6NDG6 321 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf70A6NJV1 201 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 AWAT1Q58HT5 328 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf17Q8NAS9 161 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 AAMDCQ9H7C9 122 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCYAP1P18509 176 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CBLN1P23435 193 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM74A3Q4VXF1 159 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM90A2PQ658T7 463 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BAQ96A08 127 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf77Q96MU5 243 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX3Q96PT4 197 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BTX0 84 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC5AQ9NY25 188 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CEBPGP53567 150 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD13Q5VXD3 122 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SCO2A0A1W2PP80 73 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC17A3O00476 420 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 EPDR1Q9UM22 224 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 WNK1Q9H4A3 2382 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 FOLR2P14207 255 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CMTM2Q8TAZ6 248 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PARLQ9H300 379 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CITED1Q99966 193 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 NRN1Q9NPD7 142 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PRELID1Q9Y255 219 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF24Q7RTU0 167 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF727A8MUV8 499 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX7O00628 323 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 C2CD4CQ8TF44 421 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM7Q9BQ49 75 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG101Q9BSB4 218 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 OVOL1O14753 267 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 APOC3P02656 99 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 EDN2P20800 178 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 CSN1S1P47710 185 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SVBPQ8N300 66 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 CSN3P07498 182 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL11P62913 178 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 PRIMA1Q86XR5 153 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRAP04437 139 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A9P06702 114 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR1C3P42330 323 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 CNN1P51911 297 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 MLXQ9UH92 298 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF674Q2M3X9 581 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf92Q96LL3 132 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EQM0 130 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R60P59551 318 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT8Q9UHE5 227 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 C9JCJ5 164 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 ISLRO14498 428 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL35P42766 123 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF12Q9Y4X4 402 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 SOCS3O14543 225 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAPINO95295 136 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG5P63218 68 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM241Q24JQ0 296 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TVP23CQ96ET8 276 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 DERL1Q9BUN8 251 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PF4P02776 101 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms