RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580038.5

THOC1-208, Transcript of THO complex 1, human

TSL 5

Gene THOC1, Length 2,033 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THOC1-208	ENST00000580038	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	TCRA	P04437	139 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	FOXL1	Q12952	345 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	ADIRF	Q15847	76 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	MLX	Q9UH92	298 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
THOC1-208	ENST00000580038	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TSPAN4	O14817	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	ISLR	O14498	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	SMR3A	Q99954	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038		H7BYZ3	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	CHEK1	O14757	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	PSG3	Q16557	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	PDZD2	O15018	2839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038		A0A087WW49	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	OVOL1	O14753	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	GCG	P01275	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	LTA	P01374	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	POLQ	O75417	2590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	CBLN1	P23435	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	RNF212	Q495C1	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	COX19	Q49B96	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
THOC1-208	ENST00000580038	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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