RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CENPXA8MT69 81 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HRASP01112 189 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PGAM2P15259 253 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 NPPCP23582 126 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CRYBB3P26998 211 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HTR2BP41595 481 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TAS2R43P59537 309 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 B2MP61769 119 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 WT1-ASQ06250 92 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DHRS2Q13268 280 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 Q8N377 158 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PAXXQ9BUH6 204 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CKLFQ9UBR5 152 aa3.35□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 A0A096LPF7 62 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PSCAO43653 123 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR13C7P0DN81 318 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HTR2CP28335 458 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 FXYD7P58549 80 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 GNGT1P63211 74 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 COTL1Q14019 142 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF79Q15937 498 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TDRG1Q3Y452 100 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HS3ST5Q8IZT8 346 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 BAALCQ8WXS3 180 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRIM25-208ENST00000574234 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CMTM5Q96DZ9 223 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 METTL26Q96S19 204 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 AK3Q9UIJ7 227 aa3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRIM25-208ENST00000574234 SMKR1H3BMG3 65 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 I3L2K1 104 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 GNGT2O14610 69 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 BET1O15155 118 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 FABP7O15540 132 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 GNG7O60262 68 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 ADAP1O75689 374 aa3.33□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 SLC22A5O76082 557 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 UBBP0CG47 229 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 NQO2P16083 231 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 CD36P16671 472 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 UNC119Q13432 240 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 FCN2Q15485 313 aa3.33□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.33□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.33□□□□□ -1.88
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TRIM25-208ENST00000574234 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 IFITM10A6NMD0 228 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 A8MTW9 85 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 UPK2O00526 184 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 IGKV3-20P01619 116 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 IGHV3-48P01763 117 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 CDK1P06493 297 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 CD3GP09693 182 aa3.32□□□□□ -1.88
TRIM25-208ENST00000574234 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.32□□□□□ -1.88
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