RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10G4Q8NGN3 311 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10G9Q8NGN4 311 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10G7Q8NGN6 311 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 HYLS1Q96M11 299 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC50A1Q9BRV3 221 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 KNCNA6PVL3 124 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTL10Q5JWF8 245 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPRMQ9NS64 109 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PPV4 95 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYYP10082 97 aa24.42■■□□□ 1.5
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R45P59539 299 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf173Q96LM9 149 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD300CQ08708 224 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGFL4Q6B9Z1 124 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMUB2Q71RG4 321 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DL5AQ8N109 375 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51M1Q9H341 326 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF586Q9NXT0 402 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL7A1Q02388 2944 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFDN1O60925 122 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 KHDC3LQ587J8 217 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 TM2D3Q9BRN9 247 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BTX0 84 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF253O75346 499 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXI2Q6ZQN5 318 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF182Q8N6D2 247 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAXXQ9BUH6 204 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV19A0A075B6N1 114 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC17A3O00476 420 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR7C2O60412 319 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM122CQ6P4D5 195 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPP1P10451 314 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DRB4P13762 266 aa24.38■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMAT4Q9H898 229 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM41BQ5BJD5 291 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC5AQ9NY25 188 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH9Q9NYC9 4486 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BMM0 161 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB1P60022 68 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSG3Q16557 428 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP69Q49AA0 526 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF141Q8WVD5 230 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF503Q96F45 646 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA25Q9BR10 227 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSTL1Q9H114 145 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2CO00762 179 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBEAP1P0C6P0 100 aa24.35■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GDF5OSQ5U4N7 250 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 EBLN2Q6P2I7 272 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 FXYD5Q96DB9 178 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10J4P0C629 311 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DMBP28068 263 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 PQLC2Q6ZP29 291 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF738Q8NE65 137 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 BLNKQ8WV28 456 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0J9YX75 114 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 F6UB75 175 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFB4O95168 129 aa24.33■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PSG9Q00887 426 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB24Q969Q5 203 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC11BP0C7V7 166 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZWC4 215 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAP18Q8IXM2 172 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAG3L2P0CL84 134 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAG3L3P0CL85 134 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPT1P13693 172 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 STOML3Q8TAV4 291 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLUHP3Q96NS8 147 aa24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4B1Q8NGF8 309 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 AAMDCQ9H7C9 122 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 CA1P00915 261 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL14EPLP0DKL9 152 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf62Q8N4C0 152 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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