RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.73□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 SSSCA1O60232 199 aa14.72□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 CCNKO75909 580 aa14.72□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 HTN1P15515 57 aa14.72□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.72□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 APOBP04114 4563 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 C9orf170A2RU37 121 aa14.71□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 DLK1P80370 383 aa14.71□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 S100A7AQ86SG5 101 aa14.71□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 ARL6Q9H0F7 186 aa14.71□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
STX4-216ENST00000566353 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 CDK2AP2O75956 126 aa14.7□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 CDKN1BP46527 198 aa14.7□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 PATE2Q6UY27 113 aa14.7□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 SMIM8Q96KF7 97 aa14.7□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 CCDC160A6NGH7 325 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 K7EPK0 472 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 CXCL2P19875 107 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 S100A5P33763 92 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 CLINT1Q14677 625 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 ARV1Q9H2C2 271 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 FNDC10F2Z333 226 aa14.68□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 LCN15Q6UWW0 184 aa14.68□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 CCDC190Q86UF4 302 aa14.68□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.68□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 RNF24Q9Y225 148 aa14.68□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 H7BYZ3 331 aa14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 NDUFB6O95139 128 aa14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 TEPPQ6URK8 271 aa14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 SSX7Q7RTT5 188 aa14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.67□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 SCGB1D2O95969 90 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 ZNF546Q86UE3 836 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 OR4E1P0C645 316 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 KIR3DS1Q14943 382 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-216ENST00000566353 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 GOSR2O14653 212 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 TSC22D2O75157 780 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 OR5I1Q13606 314 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 SRRQ9GZT4 340 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 SLC17A3O00476 420 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 AGPAT2O15120 278 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 INPP1P49441 399 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 TAS2R30P59541 319 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 Q9H8V8 135 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 PRAC2D3DTV9 90 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 H3BTX0 84 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 COX7A2P2O60397 106 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 M6PRP20645 277 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 ARL16Q0P5N6 197 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 C4orf46Q504U0 113 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 TTC32Q5I0X7 151 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 ZNF503Q96F45 646 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 A0A0J9YY99 117 aa14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 HOXA5P20719 270 aa14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 MORN5Q5VZ52 161 aa14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 TRIQKQ629K1 86 aa14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 GAGE12BA1L429 117 aa14.6□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 GAGE7O76087 117 aa14.6□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 RLN2P04090 185 aa14.6□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 GAGE12FP0CL80 117 aa14.6□□□□□ -0.07
STX4-216ENST00000566353 GAGE12GP0CL81 117 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms