RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	M6PR	P20645	277 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	RHOB	P62745	196 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	SSX7	Q7RTT5	188 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	BLNK	Q8WV28	456 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	GPR82	Q96P67	336 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744		A0A087X0K7	114 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PPV4	95 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744		F6UB75	175 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	IGLC2	P0DOY2	106 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ID1	P41134	155 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF503	Q96F45	646 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	PAXX	Q9BUH6	204 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	RPRM	Q9NS64	109 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV3-20	P01619	116 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	SPP1	P10451	314 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	PSMB3	P49720	205 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	MEOX2	P50222	304 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF726P1	Q15940	193 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	KHDC3L	Q587J8	217 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	LCN15	Q6UWW0	184 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF738	Q8NE65	137 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	TMED6	Q8WW62	240 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	RAB24	Q969Q5	203 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	OR51M1	Q9H341	326 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	RETN	Q9HD89	108 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1B0GV50	99 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ISLR	O14498	428 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	MB	P02144	154 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	FHIT	P49789	147 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	FXYD7	P58549	80 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	TAS2R45	P59539	299 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	SERF2	P84101	59 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	BAP18	Q8IXM2	172 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	RNF141	Q8WVD5	230 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	FXYD5	Q96DB9	178 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	HRH4	Q9H3N8	390 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	RNF24	Q9Y225	148 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPL4-208	ENST00000564744	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFB4	O95168	129 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PSG3	Q16557	428 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	HAGH	Q16775	308 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	STH	Q8IWL8	128 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	STOML3	Q8TAV4	291 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	PRAC2	D3DTV9	90 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744		M0R3E3	92 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SEC11B	P0C7V7	166 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	STAG3L2	P0CL84	134 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	STAG3L3	P0CL85	134 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	GCHFR	P30047	84 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	ICAM4	Q14773	271 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	SLC51B	Q86UW2	128 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPL4-208	ENST00000564744	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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