RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 ORM2P19652 201 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-DMAP28067 261 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 CD300CQ08708 224 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 WFDC2Q14508 124 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 LELP1Q5T871 98 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 BLNKQ8WV28 456 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 TP53RKQ96S44 253 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 VGLL1Q99990 258 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 SSR3Q9UNL2 185 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-30P01768 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-33P01772 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 CXCL3P19876 107 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 RCVRNP35243 200 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 LEPP41159 167 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 UCP3P55916 312 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 PIGPP57054 158 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 LAGE3Q14657 143 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 NEDD8Q15843 81 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 NMSQ5H8A3 153 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 TRGV9Q99603 122 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 PAXXQ9BUH6 204 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 U3KQ87 197 aa6.35□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0D9SG52 128 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0G2JRQ6 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK4O60575 86 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 CCNKO75909 580 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 RAP2BP61225 183 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 RND3P61587 244 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 GPR107Q5VW38 600 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 LGI3Q8N145 548 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 Q8N976 141 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 COPZ2Q9P299 210 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 COX11Q9Y6N1 276 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 TCL1AP56279 114 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 FHL2Q14192 279 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 SP6Q3SY56 376 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 S100A7AQ86SG5 101 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 THAP8Q8NA92 274 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 IL22RA2Q969J5 263 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 B3GALNT1O75752 331 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 NAT1P18440 290 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 PI3P19957 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS3P35030 304 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 MXD1Q05195 221 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF846Q147U1 533 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 AARDQ4LEZ3 155 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 TOR2AQ5JU69 321 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 BAALCQ8WXS3 180 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM18P0DKX4 95 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 RAB11AP62491 216 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 OR1S1Q8NH92 325 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 DTD1Q8TEA8 209 aa6.31□□□□□ -1.4
SMAD3-211ENST00000559460 RMI2Q96E14 147 aa6.31□□□□□ -1.4
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