RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555503.1

GPHN-208, Transcript of gephyrin, human

TSL 3

Gene GPHN, Length 655 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-208	ENST00000555503	IFNA21	P01568	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	CD3D	P04234	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	NPY1R	P25929	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	RND3	P61587	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503		F6UB75	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	ATG12	O94817	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	APOA1	P02647	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	CD74	P04233	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	VBP1	P61758	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	FGL1	Q08830	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503		Q8WTZ3	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503		Q9HAA7	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	BUB3	O43684	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	PRM2	P04554	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ANXA3	P12429	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	UCP1	P25874	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	HTR2B	P41595	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	RORC	P51449	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	SPCS3	P61009	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503		Q6ZR54	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	SLC25A4	P12235	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ID1	P41134	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	PAX9	P55771	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	LYZ	P61626	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	CDS2	O95674	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	RAB3D	O95716	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	HBE1	P02100	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	DAD1	P61803	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF90	Q03938	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	OR2F1	Q13607	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPHN-208	ENST00000555503	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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