RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554900.1

RPS6KL1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, human

TSL 5

Gene RPS6KL1, Length 445 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KL1-208	ENST00000554900	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SORL1	Q92673	2214 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	STAG3L3	P0CL85	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PRR25	Q96S07	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR11H12	B2RN74	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SOCS3	O14543	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CXorf1	O96002	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CD7	P09564	240 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PYY	P10082	97 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SULT1A2	P50226	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PSG9	Q00887	426 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900		H3BQ15	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	RYR3	Q15413	4870 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR10J4	P0C629	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	DEFB131A	P59861	70 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	GCHFR	P30047	84 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900		Q8N1Y9	231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HBE1	P02100	147 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FHIT	P49789	147 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900		A8MZ25	164 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900		H3BTX0	84 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SLC17A3	O00476	420 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IFNA7	P01567	189 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PPT1	P50897	306 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PSG3	Q16557	428 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	NDUFB4	O95168	129 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	DEFB125	Q8N687	156 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF738	Q8NE65	137 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900		A0A1W2PRE2	83 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CSN1S1	P47710	185 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RPS6KL1-208	ENST00000554900	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64

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