RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	DERL3	Q96Q80	235 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	COMMD9	Q9P000	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		A8MTW9	85 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		F6UB75	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PANO1	I0J062	215 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		M0R2Z0	102 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CORT	O00230	105 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	ISLR	O14498	428 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TNFSF12	O43508	249 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	LIMS3	P0CW19	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	LIMS4	P0CW20	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	ELK1	P19419	428 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	GADD45A	P24522	165 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	FLOT2	Q14254	428 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	GAMT	Q14353	236 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC01620	Q4KN68	170 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR4X1	Q8NH49	305 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CIB1	Q99828	191 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PARL	Q9H300	379 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	POMP	Q9Y244	141 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SULT1C2	O00338	296 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CNIH2	Q6PI25	160 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SPATA24	Q86W54	205 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		Q8N976	141 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		Q9HAA7	133 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	AMBN	Q9NP70	447 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A0J9YXV3	536 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		H7BYZ3	331 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686		K7EQD1	137 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	BCL2L11	O43521	198 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	KRAS	P01116	189 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IL4	P05112	153 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	MYL12A	P19105	171 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	DTYMK	P23919	212 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	MEOX2	P50222	304 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	ARL6IP1	Q15041	203 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TIGIT	Q495A1	244 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	BAP18	Q8IXM2	172 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	BORCS5	Q969J3	196 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM210A	Q96ND0	272 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	RD3L	P0DJH9	198 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	SRI	P30626	198 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OPRK1	P41145	380 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	ETV1	P50549	477 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	HES5	Q5TA89	166 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR51H1	Q8NH63	302 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-223	ENST00000553686	OR4A16	Q8NH70	328 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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