RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SORL1Q92673 2214 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C9JCJ5 164 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 BUB3O43684 328 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TRGC2P03986 189 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 USMG5Q96IX5 58 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JLM5 398 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGLV1-40P01703 118 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RNF182Q8N6D2 247 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 YPEL4Q96NS1 127 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 OTORQ9NRC9 128 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 AKAP9Q99996 3911 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGLV2-8P01709 118 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RAB5BP61020 215 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PSMB8P28062 276 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TM4SF20Q53R12 229 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ZNF702PQ9H963 129 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RNF24Q9Y225 148 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGHG4P01861 327 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 S100A6P06703 90 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SRD5A1P18405 259 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TAS2R60P59551 318 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 GPR82Q96P67 336 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 HIVEP1P15822 2718 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 EDN2P20800 178 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CSN1S1P47710 185 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CFHR3Q02985 330 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 H3BUA1 57 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PPP1R2P9O14990 202 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 GCGP01275 180 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 KLK9Q2XQG4 91 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 DEFB136Q30KP8 78 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FRZBQ92765 325 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 CD99P14209 185 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 RPEL1Q2QD12 228 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 Q8TAT8 98 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 DUX3Q96PT4 197 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ESM1Q9NQ30 184 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.46□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 DIRC3C9JPN6 131 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 K7EQM0 130 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 S100A7P31151 101 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 AKR1D1P51857 326 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 SSTP61278 116 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PRR31Q5SQ13 230 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 NUDT11Q96G61 164 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 FMC1Q96HJ9 113 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 V9GYV3 84 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HAX1O00165 279 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 NDUFA4O00483 81 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 CD5LO43866 347 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PDE6HQ13956 83 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 CHEK1O14757 476 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 LTAP01374 205 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 IGLV2-11P01706 119 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 FOLR2P14207 255 aa6.44□□□□□ -1.38
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