RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 AGPAT2O15120 278 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPOP30536 169 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A7P31151 101 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 INPP1P49441 399 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 FCN2Q15485 313 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TEPPQ6URK8 271 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 BAP18Q8IXM2 172 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 MGST2Q99735 147 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 GGACTQ9BVM4 153 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.32□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RYR1P21817 5038 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CENPXA8MT69 81 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PRAC2D3DTV9 90 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CCSO14618 274 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SCGB1D2O95969 90 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TCRBP04435 133 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 KIR3DS1Q14943 382 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF212Q495C1 297 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF738Q8NE65 137 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 A6NHS1 94 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LYRM9A8MSI8 78 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BQ15 152 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LYRM1O43325 122 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 INSP01308 110 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLC2P0DOY2 106 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 HTN3P15516 51 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 B2MP61769 119 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 DAD1P61803 113 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.3□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC17A3O00476 420 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 GOSR2O14653 212 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 OPCMLQ14982 345 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 VWC2Q2TAL6 325 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF546Q86UE3 836 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.29□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BTX0 84 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CST7O76096 145 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CXCL2P19875 107 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TAS2R60P59551 318 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RHOBP62745 196 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01587Q99440 93 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.28□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB130BP0DP73 79 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB130AP0DP74 79 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 CDKN1BP46527 198 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 MIC13Q5XKP0 118 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 LCN15Q6UWW0 184 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C2orf50Q96LR7 162 aa8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 HSPG2P98160 4391 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 IGSF23A1L1A6 192 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 CBY3A6NI87 242 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 CT45A10P0DMU9 189 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 CAMLGP49069 296 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A7AQ86SG5 101 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 NUDT15Q9NV35 164 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF24Q9Y225 148 aa8.26□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM25EA8MYX2 175 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 L7N2F9 121 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 COX7A2P2O60397 106 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 VAMP2P63027 116 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB32Q13637 225 aa8.25□□□□□ -1.09
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