RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CACNG5Q9UF02 275 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAT1P18440 290 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEF2DQ14814 521 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOXA1Q86UR1 476 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR82Q96P67 336 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0A6YYH2 397 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A6NJ64 397 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAC2D3DTV9 90 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD300CQ08708 224 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TDRG1Q3Y452 100 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGI3Q8N145 548 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8N3U1 123 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRGV9Q99603 122 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VGLL1Q99990 258 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAXXQ9BUH6 204 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0U1RQV1 116 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A10P0DMU9 189 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UCP3P55916 312 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF479Q96JC4 524 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9JCJ5 164 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORM1P02763 201 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDC2P34741 201 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCVRNP35243 200 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCL1AP56279 114 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AARDQ4LEZ3 155 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEPPQ6URK8 271 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8N976 141 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP21Q9H596 190 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 U3KQ87 197 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BTX0 84 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LEPP41159 167 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RND3P61587 244 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF846Q147U1 533 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01600Q96MT4 127 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COPZ2Q9P299 210 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF222A6NCQ9 220 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BRN7 92 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS3P35030 304 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTN1A1Q13410 526 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DTD1Q8TEA8 209 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBKSQ9H477 322 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSR3Q9UNL2 185 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0D9SG52 128 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C7orf71A4D174 169 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5G3P0C626 314 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A7P31151 101 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAP2BP61225 183 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087X0K7 114 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDS2O95674 445 aa6.54□□□□□ -1.36
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