RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF738Q8NE65 137 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV3-20P01619 116 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRK-222ENST00000532751 FAM78BQ5VT40 261 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRK-222ENST00000532751 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRK-222ENST00000532751 HRH4Q9H3N8 390 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRK-222ENST00000532751 DNAH7Q8WXX0 4024 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 PSG3Q16557 428 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 GUK1Q16774 197 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 GCSAMLQ5JQS6 135 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 CASC10Q5T4H9 136 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 CLEC5AQ9NY25 188 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 XCL2Q9UBD3 114 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 IGLC2P0DOY2 106 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 PSG9Q00887 426 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 AQP10Q96PS8 301 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF266Q14584 549 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 Q5BKY6 102 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 WFDC1Q9HC57 220 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 H3BTX0 84 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 HLA-DMBP28068 263 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 H3BQ15 152 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 CNN1P51911 297 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 FXYD7P58549 80 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 MIR17HGQ75NE6 70 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 MFFQ9GZY8 342 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 FUT9Q9Y231 359 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 A8MTW9 85 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 SLC17A3O00476 420 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF253O75346 499 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 MIFP14174 115 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-222ENST00000532751 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 SLC25A2Q9BXI2 301 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 AMBPP02760 352 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 PYYP10082 97 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 RHOBP62745 196 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 PDE6HQ13956 83 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 OR51M1Q9H341 326 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 X6R8D5 127 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 TRBV19A0A075B6N1 114 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 BLNKQ8WV28 456 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 TAS2R45P59539 299 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 AMTNQ6UX39 209 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 Q8NAQ8 132 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 PAXXQ9BUH6 204 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 RNF222A6NCQ9 220 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 DEFB4AO15263 64 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 OR7C2O60412 319 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 M6PRP20645 277 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 KHDC3LQ587J8 217 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 AAMDCQ9H7C9 122 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 PRELID1Q9Y255 219 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PPV4 95 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 NBEAP1P0C6P0 100 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 PMS2P11Q13670 270 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 NEU1Q99519 415 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-222ENST00000532751 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-222ENST00000532751 CXorf65A6NEN9 183 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-222ENST00000532751 SPINK13Q1W4C9 94 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-222ENST00000532751 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-222ENST00000532751 RNF141Q8WVD5 230 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-222ENST00000532751 RFNGQ9Y644 331 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-222ENST00000532751 G3V3Q6 166 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms