RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 PBDC1Q9BVG4 233 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 BOLA2Q9H3K6 86 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUP98P52948 1817 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 H3BRM9 83 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 RER1O15258 196 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 KLRD1Q13241 179 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 LTC4SQ16873 150 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 TEN1Q86WV5 123 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR5AS1Q8N127 324 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 RTL8AQ9BWD3 113 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR52A1Q9UKL2 312 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 TNFSF18Q9UNG2 199 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 EML5Q05BV3 1969 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 UNC13CQ8NB66 2214 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 PEAK1Q9H792 1746 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR2T8A6NH00 312 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 HIST1H2BKO60814 126 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 HIST1H2BJP06899 126 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 GLRXP35754 106 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP1R2P41236 205 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 CRYBA4P53673 196 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 HBBP68871 147 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 FKBP1CQ5VVH2 108 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR10AG1Q8NH19 301 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM138Q9NPI0 162 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 GID8Q9NWU2 228 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 ALPK3Q96L96 1907 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 CD109Q6YHK3 1445 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-677P-201ENST00000516914 FREM3P0C091 2139 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 hDV103S1A0JD37 113 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 IFNA4P05014 189 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 RTL8BQ17RB0 113 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 OTORQ9NRC9 128 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MED12Q93074 2177 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A1W2PPM0 123 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 C5orf67F2Z3F1 127 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 IDO1P14902 403 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 G0S2P27469 103 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 GNG10P50151 68 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TCTAP57738 103 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBR2Q8IWV8 1755 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 IFT20Q8IY31 132 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 LRRC18Q8N456 261 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 STX19Q8N4C7 294 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM216BQ8N7L0 139 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 NEK7Q8TDX7 302 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PSMF1Q92530 271 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR2H1Q9GZK4 316 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 BIN3Q9NQY0 253 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 NISCHQ9Y2I1 1504 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MGAMO43451 1857 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 C9orf170A2RU37 121 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 E5RI56 91 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPR31O00270 319 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRR15Q8IV56 129 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 WFDC10AQ9H1F0 79 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TAF9BQ9HBM6 251 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 IL20Q9NYY1 176 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 COL24A1Q17RW2 1714 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 NCAPD3P42695 1498 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 TET1Q8NFU7 2136 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 RTL9Q8NET4 1388 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP5D1E7EU14 171 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 LYRM1O43325 122 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 CST7O76096 145 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPYP01298 95 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 IGLV3-1P01715 115 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 IGHV3-33P01772 117 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 SERPINB1P30740 379 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 RPL35P42766 123 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 VBP1P61758 197 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 MIR22HGQ0VDD5 57 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 C3orf33Q6P1S2 294 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00575Q6W349 94 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 FOXI2Q6ZQN5 318 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 LINC00269Q8N2A0 174 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM24BQ8N5W8 94 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 LRTM1Q9HBL6 345 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms