RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-215	ENST00000514596	RETN	Q9HD89	108 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	GUK1	Q16774	197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596		H3BMM0	161 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596		Q6ZNX1	250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CTBP1-215	ENST00000514596	HERC2	O95714	4834 aa		13.71	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ARPC5	O15511	151 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF253	O75346	499 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	RNF183	Q96D59	192 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596		A0A0J9YX75	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	SPRY2	O43597	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	RHOB	P62745	196 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	TAAR5	O14804	337 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	M6PR	P20645	277 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PDE6H	Q13956	83 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF345	Q14585	488 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PSG3	Q16557	428 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	HMSD	A8MTL9	139 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596		H3BQ15	152 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC17A3	O00476	420 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	C4BPB	P20851	252 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	TAS2R45	P59539	299 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	DEFB1	P60022	68 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596		F6UB75	175 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	LY6G6C	O95867	125 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PYY	P10082	97 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	SERF2	P84101	59 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596		A8MTW9	85 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596		H3BTX0	84 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	OR7C2	O60412	319 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	MB	P02144	154 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CTBP1-215	ENST00000514596	HLA-DMB	P28068	263 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	RAB2A	P61019	212 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	PSG9	Q00887	426 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596		A0A1W2PPV4	95 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CTBP1-215	ENST00000514596	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23

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