RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-215	ENST00000514141	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	UBE2L6	O14933	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PLAU	P00749	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	COX6C	P09669	75 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141		A8MWP6	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	NDUFA7	O95182	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	NUDT3	O95989	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	IGHG4	P01861	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	CRYBA4	P53673	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	LINC00614	P0C842	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	CFHR4	Q92496	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141		K7EIM0	57 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	GP9	P14770	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PRR25	Q96S07	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	CCL25	O15444	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	MGP	P08493	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	TAL2	Q16559	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	SH2D1A	O60880	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	ESD	P10768	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	LAGE3	Q14657	143 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141		H3BQ85	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	SIVA1	O15304	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141		Q8N7P7	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141		Q8N8P6	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141		Q96MF0	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	DPM2	O94777	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	KLRD1	Q13241	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141		Q6YL49	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	CDKN1B	P46527	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POLK-215	ENST00000514141	PYY	P10082	97 aa		4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	PTH2	Q96A98	100 aa		4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141		V9GYV3	84 aa		4.59	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	NCOR1	O75376	2440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POLK-215	ENST00000514141	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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