RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 F5H768 121 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 SCGB1D2O95969 90 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 HTN1P15515 57 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 C4orf46Q504U0 113 aa11.89□□□□□ -0.51
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HERC3-211ENST00000513325 S100A7AQ86SG5 101 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ARV1Q9H2C2 271 aa11.89□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 PCLOQ9Y6V0 5065 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 FNDC10F2Z333 226 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 K7EPK0 472 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R60P59551 318 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 TEPPQ6URK8 271 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZNF575Q86XF7 245 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 NUDT3O95989 172 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ATP5G1P05496 136 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ATP5G3P48201 142 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ARL16Q0P5N6 197 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 CBY3A6NI87 242 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 GOSR2O14653 212 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 TSC22D2O75157 780 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 CDKN1BP46527 198 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R30P59541 319 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 C16orf74Q96GX8 76 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 RNF24Q9Y225 148 aa11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 AGPAT2O15120 278 aa11.85□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 BTCP35070 178 aa11.85□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 LCN15Q6UWW0 184 aa11.85□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZNF546Q86UE3 836 aa11.85□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.85□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 C7orf66A4D0T2 115 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 CENPXA8MT69 81 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 H3BTX0 84 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 CXCL2P19875 107 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 KIR3DS1Q14943 382 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 MITD1Q8WV92 249 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HERC3-211ENST00000513325 H7BYZ3 331 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 COX7A2P2O60397 106 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CCL18P55774 89 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 TNP2Q05952 138 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 MORN5Q5VZ52 161 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 RNF141Q8WVD5 230 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 MGST2Q99735 147 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 GGACTQ9BVM4 153 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 MUC4Q99102 2169 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 PRAC2D3DTV9 90 aa11.82□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 SLC17A3O00476 420 aa11.82□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 L7N2F9 121 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CCSO14618 274 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 VAMP2P63027 116 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 OPCMLQ14982 345 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 C6orf223Q8N319 242 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 H3BQ15 152 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 IGLC2P0DOY2 106 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 IL7P13232 177 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 OR5I1Q13606 314 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CLINT1Q14677 625 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 J3KRW8 73 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CAMLGP49069 296 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 BCAP31P51572 246 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 ZNF846Q147U1 533 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 SSX7Q7RTT5 188 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.79□□□□□ -0.52
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