RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 C7orf71A4D174 169 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FA2HQ7L5A8 372 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FCN1O00602 326 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 DEFA5Q01523 94 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 TDRG1Q3Y452 100 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 GFI1Q99684 422 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 RAB4AP20338 218 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 SEC11CQ9BY50 192 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM262E9PQX1 116 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FCN3O75636 299 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PMCHP20382 165 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF134P52741 427 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FRZBQ92765 325 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 S4R3C0 116 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV1-5P01602 117 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV1-40P01703 118 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 HERVK_113P61574 105 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 BSXQ3C1V8 233 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 J3KRW8 73 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PEX7O00628 323 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 APOMO95445 188 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 P0DMU3 169 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM231AP0DMU4 169 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM231CP0DMU5 169 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 SPNP16150 400 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM250H0YL14 139 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 H3BRN7 92 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CNTFRP26992 372 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 OR11H2Q8NH07 326 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 C3orf84H3BNL1 204 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 DIRC3C9JPN6 131 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 DEFA6Q01524 100 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 RHOHQ15669 191 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CRYBB3P26998 211 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 SEC11AP67812 179 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF79Q15937 498 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLC1P0CG04 106 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CITED1Q99966 193 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 EYSQ5T1H1 3165 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PLP1P60201 277 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 SOSTQ9BQB4 213 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 MT-ND6P03923 174 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 REV3LO60673 3130 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 HAGHQ16775 308 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 EPDR1Q9UM22 224 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PSG8Q9UQ74 426 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CDH23Q9H251 3354 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PAGE4O60829 102 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PPBPP02775 128 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 BCL2P10415 239 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 COTL1Q14019 142 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CGB1A6NKQ9 187 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV2-23P01705 113 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 PRR25Q96S07 402 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 WT1-ASQ06250 92 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 XCL2Q9UBD3 114 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 COMMD7Q86VX2 200 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
POLR2J3-215ENST00000511313 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 GGTLC3B5MD39 225 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 I3L2K1 104 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR2J3-215ENST00000511313 PLA2G10O15496 165 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms