RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	HLA-DRB4	P13762	266 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	CXCL2	P19875	107 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	AQP10	Q96PS8	301 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	RPRM	Q9NS64	109 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	MORN5	Q5VZ52	161 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	C17orf77	Q96MU5	243 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148		H3BMM0	161 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF266	Q14584	549 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	RARRES2	Q99969	163 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	DEFB4A	O15263	64 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	C20orf173	Q96LM9	149 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	IGLC2	P0DOY2	106 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	C4BPB	P20851	252 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	FAM78B	Q5VT40	261 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	GUK1	Q16774	197 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148		Q5BKY6	102 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	RNF182	Q8N6D2	247 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0J9YX75	114 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	DEFB1	P60022	68 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MIB2-223	ENST00000508148	RNF222	A6NCQ9	220 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		F6UB75	175 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF253	O75346	499 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		Q8NAQ8	132 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		G3V3Q6	166 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		H3BQ15	152 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	SLC17A3	O00476	420 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV3-20	P01619	116 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	PSG3	Q16557	428 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	FUT9	Q9Y231	359 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		A8MTW9	85 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	RHOB	P62745	196 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	PSG9	Q00887	426 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	PDE6H	Q13956	83 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	MFF	Q9GZY8	342 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	APLN	Q9ULZ1	77 aa		12	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		H3BTX0	84 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ARPC5	O15511	151 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	PYY	P10082	97 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	TAS2R45	P59539	299 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	KHDC3L	Q587J8	217 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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