RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496153.5

BUD23-218, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, human

TSL 4

Gene BUD23, Length 505 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BUD23-218	ENST00000496153	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BUD23-218	ENST00000496153	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BUD23-218	ENST00000496153	PSG9	Q00887	426 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BUD23-218	ENST00000496153	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BUD23-218	ENST00000496153	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BUD23-218	ENST00000496153	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BUD23-218	ENST00000496153		F6UB75	175 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	DEFB1	P60022	68 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF266	Q14584	549 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	PSG3	Q16557	428 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	XCL2	Q9UBD3	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	MIF	P14174	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF253	O75346	499 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	AMBP	P02760	352 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153		H3BQ15	152 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	FXYD7	P58549	80 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	RHOB	P62745	196 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	PDE6H	Q13956	83 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153		A8MTW9	85 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153		H3BTX0	84 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	SLC17A3	O00476	420 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	HLA-DMB	P28068	263 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	TAS2R45	P59539	299 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BUD23-218	ENST00000496153	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	CXorf65	A6NEN9	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153		Q8NAQ8	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	OR7C2	O60412	319 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	PYY	P10082	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153		Q5BKY6	102 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153		X6R8D5	127 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153		A0A1W2PPV4	95 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	NUPR2	A6NF83	97 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	INS	P01308	110 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	M6PR	P20645	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	NEU1	Q99519	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	DEFB4A	O15263	64 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BUD23-218	ENST00000496153		M0R2Z0	102 aa		13.54	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms