RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 CEP250Q9BV73 2442 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 hADV38S2A0JD32 116 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LILRA5A6NI73 299 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 DUX1O43812 170 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SRYQ05066 204 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TEX29Q8N6K0 151 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 NPYP01303 97 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 MEOX1P50221 254 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PCBD1P61457 104 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PRNTQ86SH4 94 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE12JA6NER3 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 OOEPA6NGQ2 149 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 C15orf65H3BRN8 121 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SCRG1O75711 98 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE7O76087 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE12FP0CL80 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE12GP0CL81 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE12IP0CL82 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ORM2P19652 201 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 CRIP1P50238 77 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE4Q13068 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1B0GUT8 65 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1-16P04430 117 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ERVK-16P61578 105 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 NPIPB3Q92617 1050 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 COX7A2P2O60397 106 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 HIST1H4GQ99525 98 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM160Q9NX00 188 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 HIGD1BQ9P298 99 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GNG12Q9UBI6 72 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PQM1 296 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 H3BVH4 76 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV2-11P01706 119 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 HBDP02042 147 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 WDR31Q8NA23 367 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 S1PR3Q99500 378 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PKIBQ9C010 78 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ATMQ13315 3056 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 EVI2AP22794 236 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LPAL2Q16609 132 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 PDPNQ86YL7 162 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 RITA1Q96K30 269 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ENY2Q9NPA8 101 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF492Q9P255 531 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01549A6NIU2 74 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RHODO00212 210 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TCRAP04437 139 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 APELAP0DMC3 54 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 HLA-DRB4P13762 266 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ARL3P36405 182 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PCOLCEQ15113 449 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 C17orf77Q96MU5 243 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 FOXC2Q99958 501 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PINLYPA6NC86 204 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PATE3B3GLJ2 98 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SPINT2O43291 252 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CFIP05156 583 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms