RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 RHEBQ15382 184 aa8.77□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.77□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.77□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX3Q96PT4 197 aa8.77□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 OR4F4Q96R69 305 aa8.77□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.77□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SMPXQ9UHP9 88 aa8.77□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.76□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 MYCNOSP40205 109 aa8.76□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 GLMPQ8WWB7 406 aa8.76□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TVP23CQ96ET8 276 aa8.76□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.76□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 C11orf94C9JXX5 98 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 CHEK1O14757 476 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 GALR1P47211 349 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 UBE2G2P60604 165 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 PEMTQ9UBM1 199 aa8.75□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A087X0K7 114 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A1W2PRE2 83 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 C2orf70A6NJV1 201 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF727A8MUV8 499 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ATP5G3P48201 142 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 PDE6HQ13956 83 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 CST9LP1Q5W188 147 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 PDE6DO43924 150 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 CBLN1P23435 193 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 MEOX2P50222 304 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 PARLQ9H300 379 aa8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 HELTA6NFD8 242 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF253O75346 499 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 FOLR2P14207 255 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 C17orf77Q96MU5 243 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF747Q9BV97 191 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TUBA4BQ9H853 241 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.73□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 M0QZ24 198 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFB4O95168 129 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 EDN2P20800 178 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 BLNKQ8WV28 456 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A087WWC5 75 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF785A8K8V0 405 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 GGTLC3B5MD39 225 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 F6UZH7 168 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 OVOL1O14753 267 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 CSN3P07498 182 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 NAT8Q9UHE5 227 aa8.72□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 COLCA2A8K830 154 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 B4DEV8 164 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 H3BTX0 84 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 RANP62826 216 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 ISOC2Q96AB3 205 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 OTORQ9NRC9 128 aa8.71□□□□□ -1.01
SLC13A3-211ENST00000495082 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.71□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC17A3O00476 420 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 PF4P02776 101 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 PSG9Q00887 426 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 TCF24Q7RTU0 167 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 Q9H3A6 140 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 NRN1Q9NPD7 142 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 MLXQ9UH92 298 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.7□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.69□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.69□□□□□ -1.02
SLC13A3-211ENST00000495082 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.69□□□□□ -1.02
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