RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493864.1

TRA2B-216, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 2

Gene TRA2B, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-216	ENST00000493864	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	LINC01619	G3V211	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	CCL24	O00175	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	NDUFA4	O00483	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	IFNA7	P01567	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	M6PR	P20645	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	SULT1A2	P50226	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	PLP1	P60201	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	CITED1	Q99966	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRA2B-216	ENST00000493864	SORL1	Q92673	2214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	MB	P02144	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	ZP3	P21754	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	NPPC	P23582	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	RHOB	P62745	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864		A0A1B0GV50	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864		A0A1W2PPV4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864		K7EMT4	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	LGALS9	O00182	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	CRYBB3	P26998	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	MYCNOS	P40205	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	RAB5C	P51148	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	CCL20	P78556	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	METTL26	Q96S19	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	PFDN5	Q99471	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	RNF2	Q99496	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864		H3BRN7	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRA2B-216	ENST00000493864	BUB3	O43684	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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