RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493220.5

NF1-215, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 5,691 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-215	ENST00000493220	TMEM50A	O95807	157 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	GAGE5	Q13069	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	GAGE6	Q13070	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	NDUFA3	O95167	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ASIP	P42127	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	APOC4	P55056	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	LINC00205	P59089	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	CCL24	O00175	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PEX7	O00628	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	CACNG7	P62955	275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PMVK	Q15126	192 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TIRAP	P58753	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ACACA	Q13085	2346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	MT-ND6	P03923	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	NIT1	Q86X76	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220		Q8N9W7	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	MGST2	Q99735	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	DNAL4	O96015	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IGHG2	P01859	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220		A0A1W2PRE2	83 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	RS1	O15537	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	SVIL	O95425	2214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ZNF56	Q15929	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	NDUFC2	O95298	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	NPS	P0C0P6	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	CRYBB3	P26998	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	CD300C	Q08708	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PDE6H	Q13956	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	C7orf71	A4D174	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220		H7C1H1	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TSPAN13	O95857	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220		H3BTX0	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	INS	P01308	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NF1-215	ENST00000493220	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms