RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 TSPOP30536 169 aa22.18■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 LGALS9BQ3B8N2 356 aa22.18■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 LYRM9A8MSI8 78 aa22.17■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 LYRM1O43325 122 aa22.17■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 RHOBP62745 196 aa22.17■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF846Q147U1 533 aa22.17■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa22.17■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 HERC2O95714 4834 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 M0R2N4 97 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 CXCL2P19875 107 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 RNF212Q495C1 297 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 LINC00305Q7Z4B0 112 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 FAT2Q9NYQ8 4349 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 DNAH17Q9UFH2 4485 aa22.16■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 L7N2F9 121 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 CCSO14618 274 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 TCRBP04435 133 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 VAMP2P63027 116 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 TMEM88Q6PEY1 159 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 TMEM256Q8N2U0 113 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 NACAE9PAV3 2078 aa22.15■■□□□ 1.14
HMG20B-209ENST00000470356 LCN15Q6UWW0 184 aa22.14■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 MGST2Q99735 147 aa22.14■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 DNAH2Q9P225 4427 aa22.14■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 AZU1P20160 251 aa22.13■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa22.13■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 TMEM37Q8WXS4 190 aa22.13■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 LINC01587Q99440 93 aa22.13■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 SLC50A1Q9BRV3 221 aa22.13■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.13■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 TRAV6A0A075B6T7 132 aa22.12■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 RTL8CO15255 209 aa22.12■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 COX7A2P2O60397 106 aa22.12■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 A0A1B0GVY2 172 aa22.11■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 PLAC8L1A1L4L8 177 aa22.11■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 FAM25EA8MYX2 175 aa22.11■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 TAS2R60P59551 318 aa22.1■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 RAB31Q13636 194 aa22.1■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 C10orf113Q5VZT2 155 aa22.1■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 Q6ZR54 194 aa22.1■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 C15orf53Q8NAA6 179 aa22.1■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 SEC22CQ9BRL7 303 aa22.1■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 NUDT15Q9NV35 164 aa22.1■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 C5orf51A6NDU8 294 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 DEFB130BP0DP73 79 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 DEFB130AP0DP74 79 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 CDKN1BP46527 198 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 CAMLGP49069 296 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 BCAP31P51572 246 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 C11orf1Q9H5F2 150 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa22.08■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 PRSS29PA6NIE9 313 aa22.08■■□□□ 1.13
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HMG20B-209ENST00000470356 CAV2P51636 162 aa22.08■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 MORN5Q5VZ52 161 aa22.08■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 C2orf50Q96LR7 162 aa22.08■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa22.08■■□□□ 1.13
HMG20B-209ENST00000470356 PKHD1P08F94 4074 aa22.07■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 CST7O76096 145 aa22.07■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 OPCMLQ14982 345 aa22.07■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 KIAA1109Q2LD37 5005 aa22.06■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 IGLC2P0DOY2 106 aa22.06■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 FCN2Q15485 313 aa22.06■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 Q6ZRG5 221 aa22.06■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 NRARPQ7Z6K4 114 aa22.06■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 C16orf74Q96GX8 76 aa22.06■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 FAM24AA6NFZ4 105 aa22.05■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 CCDC32Q9BV29 185 aa22.05■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 UQCC1Q9NVA1 299 aa22.05■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 WDR83OSQ9Y284 106 aa22.05■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 PXMP4Q9Y6I8 212 aa22.05■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 SLC17A3O00476 420 aa22.04■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 HTN1P15515 57 aa22.04■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 VWC2Q2TAL6 325 aa22.04■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 MIC13Q5XKP0 118 aa22.04■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 ZNF493Q6ZR52 646 aa22.04■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 C20orf144Q9BQM9 153 aa22.04■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa22.04■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 CBY3A6NI87 242 aa22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 H3BQ15 152 aa22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 H3BTX0 84 aa22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 H2AFB2P0C5Z0 115 aa22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 OR10J6PQ8NGY7 276 aa22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 PRAC2D3DTV9 90 aa22.02■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 F5H768 121 aa22.02■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 H7BYZ3 331 aa22.02■■□□□ 1.12
HMG20B-209ENST00000470356 ATP5G1P05496 136 aa22.02■■□□□ 1.12
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