RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 AMTNQ6UX39 209 aa13.57□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 MARVELD1Q9BSK0 173 aa13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 NMES1Q9C002 83 aa13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 CELA1Q9UNI1 258 aa13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.57□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CXCL3P19876 107 aa13.56□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 Q6ZTC4 211 aa13.56□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP6V1FQ16864 119 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.55□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.54□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 OPCMLQ14982 345 aa13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 MIC13Q5XKP0 118 aa13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 E5RGE8 158 aa13.53□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 IGLC2P0DOY2 106 aa13.53□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 B2MP61769 119 aa13.53□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 C12orf74Q32Q52 190 aa13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 MORN5Q5VZ52 161 aa13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.53□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC39A9Q9NUM3 307 aa13.53□□□□□ -0.24
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TRAPPC10-208ENST00000469521 RLN2P04090 185 aa13.52□□□□□ -0.25
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC25A31Q9H0C2 315 aa13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.52□□□□□ -0.25
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF253O75346 499 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 H3BTX0 84 aa13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLINT1Q14677 625 aa13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 OXA1LQ15070 435 aa13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC10-208ENST00000469521 VPS13DQ5THJ4 4388 aa13.45□□□□□ -0.26
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