RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	FXYD7	P58549	80 aa		12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.98	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		A0A0J9YWU9	116 aa		12.97	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DMB	P28068	263 aa		12.97	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.97	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.97	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		A0A0J9YX75	114 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	CXCL2	P19875	107 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	AQP10	Q96PS8	301 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP19-210	ENST00000465902		H3BQ15	152 aa		12.95	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	IGLC2	P0DOY2	106 aa		12.95	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	PSG3	Q16557	428 aa		12.95	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.95	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	PYY	P10082	97 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	PSG9	Q00887	426 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	ZNF266	Q14584	549 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	GUK1	Q16774	197 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	CASC10	Q5T4H9	136 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	MFF	Q9GZY8	342 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.94	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	SLC17A3	O00476	420 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	RHOB	P62745	196 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	IL17D	Q8TAD2	202 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	BLNK	Q8WV28	456 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	FUT9	Q9Y231	359 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.93	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	SMLR1	H3BR10	107 aa		12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	DEFB4A	O15263	64 aa		12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12.92	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	OR7C2	O60412	319 aa		12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	PAXX	Q9BUH6	204 aa		12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	OR51M1	Q9H341	326 aa		12.91	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12.9	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPV4	95 aa		12.9	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	RNF222	A6NCQ9	220 aa		12.9	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	ARPC5	O15511	151 aa		12.9	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	OR10J4	P0C629	311 aa		12.9	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		12.9	□□□□□ -0.34
USP19-210	ENST00000465902	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12.89	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		12.89	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R45	P59539	299 aa		12.89	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.89	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.89	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	CXorf65	A6NEN9	183 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902		G3V3Q6	166 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902		M0R2Z0	102 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	ZNF253	O75346	499 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	MIF	P14174	115 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	M6PR	P20645	277 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V0C	P27449	155 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	RAB2A	P61019	212 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	PMS2P11	Q13670	270 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	KHDC3L	Q587J8	217 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	RNF141	Q8WVD5	230 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		12.88	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB4	O95168	129 aa		12.87	□□□□□ -0.35
USP19-210	ENST00000465902	PDE6H	Q13956	83 aa		12.87	□□□□□ -0.35

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