RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COQ8AQ8NI60 647 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GU03 582 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFITM10A6NMD0 228 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM25EA8MYX2 175 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BP45 60 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PITX3O75364 302 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZP3P21754 424 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLK9Q2XQG4 91 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLET1Q6UQ28 207 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR52E5Q8NH55 327 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DTD1Q8TEA8 209 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MITD1Q8WV92 249 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR10C1Q96KK4 312 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 E9PLD3 99 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7EIL1 84 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYB5BO43169 146 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TGOLN2O43493 480 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSSCA1O60232 199 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNA10P01566 189 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPY1RP25929 384 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OPRK1P41145 380 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BSXQ3C1V8 233 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4C12Q96R67 309 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM213A2RRL7 107 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMCO3A2RU48 225 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf70A6NJV1 201 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIX6O95475 246 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNA21P01568 189 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTSGP08311 255 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HTR2BP41595 481 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 REG3GQ6UW15 175 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACY3Q96HD9 319 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SORL1Q92673 2214 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPM2AB3EWF7 344 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNGR2O43760 224 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNG7O60262 68 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCNKO75909 580 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YIF1AO95070 293 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM50AO95807 157 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNA4P05014 189 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOLR2P14207 255 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LEPP41159 167 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RND2P52198 227 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFA1P59665 94 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFA3P59666 94 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf83Q53S99 150 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPHB5Q86YW7 130 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRAPQ8TCY5 172 aa6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOSR2O14653 212 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV1-51P01701 117 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL5P05113 134 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A6P12236 298 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CBLN1P23435 193 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF2Q99496 336 aa6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 U3KQ87 197 aa6.16□□□□□ -1.42
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