RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 S4R3C0 116 aa7.12□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087X0K7 114 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PS18 150 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 GGTLC3B5MD39 225 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 TYMSP04818 313 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 PYYP10082 97 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 GALR1P47211 349 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZSV7 163 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF329Q86UD4 541 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 OCC1Q8TAD7 63 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 SFRP2Q96HF1 295 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 METTL26Q96S19 204 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 DERL1Q9BUN8 251 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 ESM1Q9NQ30 184 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTORQ9NRC9 128 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFA7O95182 113 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 CXCL1P09341 107 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM6P0DI80 62 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNG4P50150 75 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSG9Q00887 426 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 EPDR1Q9UM22 224 aa7.11□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 PGPA6NDG6 321 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5orf52A6NGY3 159 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 LGALS9O00182 355 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 GCGP01275 180 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 S100A6P06703 90 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 RANP62826 216 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNB4Q9HAV0 340 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 OSTCQ9NRP0 149 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPP5D1E7EU14 171 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 ISLRO14498 428 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 AKR1D1P51857 326 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 CENPWQ5EE01 88 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 LEMD1Q68G75 181 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 REC114Q7Z4M0 266 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMR3AQ99954 134 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-202ENST00000444658 PEX7O00628 323 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2CO00762 179 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 BMI1P35226 326 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 BLNKQ8WV28 456 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATG101Q9BSB4 218 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q9H3A6 140 aa7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOTCH2Q04721 2471 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7EN84 100 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRLF1O75462 422 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV12-3P01733 135 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-11P01762 117 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 TCRAP04437 139 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX19Q49B96 90 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01006Q8NI28 216 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 FMC1Q96HJ9 113 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 DUX5Q96PT3 197 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL36BQ9NZH7 164 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMPXQ9UHP9 88 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169 ms