RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431099.3

CBWD1-208, Transcript of COBW domain containing 1, human

TSL 5

Gene CBWD1, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD1-208	ENST00000431099	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	MUC4	Q99102	2169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099		A8MTW9	85 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	AMBP	P02760	352 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	AMT	P48728	403 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PLP1	P60201	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	B2M	P61769	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	WRB	O00258	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SOCS3	O14543	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TSC22D2	O75157	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	NDUFB4	O95168	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	OR4E1	P0C645	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	C4BPB	P20851	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	LYZ	P61626	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	DLK1	P80370	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF90	Q03938	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	OXA1L	Q15070	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099		A0A0J9YX75	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	HYPM	O75409	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	HOXB5	P09067	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IAPP	P10997	89 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	CXCL2	P19875	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PSG9	Q00887	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	DOK5	Q9P104	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099		A0A087X0K7	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IGLL5	B9A064	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	DEDD	O75618	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IL5	P05113	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099		P0DMU3	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IL7	P13232	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	TSPO	P30536	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	RAB31	Q13636	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD1-208	ENST00000431099	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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