RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 U3KQK5 164 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 H3BMM0 161 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SPP1P10451 314 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 HLA-DRB4P13762 266 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 AKAP14Q86UN6 197 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-210ENST00000423693 A0A1W2PPV4 95 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 KNCNA6PVL3 124 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 H3BQ15 152 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 PSG9Q00887 426 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 PSG3Q16557 428 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 KHDC3LQ587J8 217 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 C20orf173Q96LM9 149 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RCHY1Q96PM5 261 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OR51M1Q9H341 326 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 HYLS1Q96M11 299 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 PAXXQ9BUH6 204 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 A0A0J9YX75 114 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 BCL2L11O43521 198 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 C1QBP02746 253 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RAB2AP61019 212 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RNF182Q8N6D2 247 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF738Q8NE65 137 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RNF141Q8WVD5 230 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RNF183Q96D59 192 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 PRELID1Q9Y255 219 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RFNGQ9Y644 331 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 A8MTW9 85 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 SPRY2O43597 315 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OR7C2O60412 319 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 PYYP10082 97 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 TMUB2Q71RG4 321 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 FXYD5Q96DB9 178 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 SLC17A3O00476 420 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 PFDN1O60925 122 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 NDUFB4O95168 129 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 F6UB75 175 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 H3BTX0 84 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 SEC11BP0C7V7 166 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 STAG3L2P0CL84 134 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 STAG3L3P0CL85 134 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 C4BPBP20851 252 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 DEFB135Q30KP9 77 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 BLNKQ8WV28 456 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 RAB24Q969Q5 203 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF503Q96F45 646 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-210ENST00000423693 TGP01266 2768 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 AMBPP02760 352 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-210ENST00000423693 OR10J4P0C629 311 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.9 ms