RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 CD300CQ08708 224 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 PDE6HQ13956 83 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF124Q15973 351 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZFP69Q49AA0 526 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 OR51M1Q9H341 326 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 RPRMQ9NS64 109 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BQ15 152 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 PYYP10082 97 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 STHQ8IWL8 128 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 KIR2DL5AQ8N109 375 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 STOML3Q8TAV4 291 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 OR7C2O60412 319 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SEC11BP0C7V7 166 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 APOC4P55056 127 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 HAGHQ16775 308 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 LINC00052Q96N35 136 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 PAXXQ9BUH6 204 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC17A3O00476 420 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 STAG3L2P0CL84 134 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 STAG3L3P0CL85 134 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 HLA-DRB4P13762 266 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 C4BPBP20851 252 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 BAP18Q8IXM2 172 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 RNF141Q8WVD5 230 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 FXYD5Q96DB9 178 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF503Q96F45 646 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 C20orf173Q96LM9 149 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 KNCNA6PVL3 124 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 UBE2CO00762 179 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 PSG9Q00887 426 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 PSG3Q16557 428 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 RNF182Q8N6D2 247 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 RAB24Q969Q5 203 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 AGRNO00468 2067 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A0J9YX75 114 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 UMAD1C9J7I0 102 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BMM0 161 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 H3BTX0 84 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 NDUFB4O95168 129 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 OR10J4P0C629 311 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC51BQ86UW2 128 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 SPATA25Q9BR10 227 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 PRELID1Q9Y255 219 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 A8MTW9 85 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 HLA-DMBP28068 263 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF738Q8NE65 137 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 BLNKQ8WV28 456 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ASCL2Q99929 193 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 CSTL1Q9H114 145 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 ZMAT4Q9H898 229 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTBP8-201ENST00000403258 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 CXorf1O96002 111 aa11.2□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.2□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 Q6ZWC4 215 aa11.2□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 F6UB75 175 aa11.19□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ACTBP8-201ENST00000403258 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms