RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 LINC01587Q99440 93 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 PKD1P98161 4303 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.26□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.26□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 C16orf90A8MZG2 172 aa7.26□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 H3BMQ9 156 aa7.26□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 LINC00869P0C866 280 aa7.26□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 ATP5G3P48201 142 aa7.26□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.26□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.25□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.24□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 ARL6Q9H0F7 186 aa7.24□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.22□□□□□ -1.25
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CLRN3-201ENST00000368671 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.21□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.21□□□□□ -1.26
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CLRN3-201ENST00000368671 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.21□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM8Q96KF7 97 aa7.21□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.21□□□□□ -1.26
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CLRN3-201ENST00000368671 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.2□□□□□ -1.26
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CLRN3-201ENST00000368671 H7BYZ3 331 aa7.2□□□□□ -1.26
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CLRN3-201ENST00000368671 CDK2AP2O75956 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 CXCL2P19875 107 aa7.2□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.2□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 LCN15Q6UWW0 184 aa7.2□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.2□□□□□ -1.26
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF546Q86UE3 836 aa7.2□□□□□ -1.26
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