RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 FAM122AQ96E09 287 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 SLC35E1Q96K37 410 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 OR8B2Q96RD0 313 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 S1PR3Q99500 378 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 C19orf24Q9BVV8 132 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 SLC35D1Q9NTN3 355 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CLCF1Q9UBD9 225 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 GNG12Q9UBI6 72 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 JPT1Q9UK76 154 aa2.56□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 C20orf202A1L168 122 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 GGTLC3B5MD39 225 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 NACAE9PAV3 2078 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 H0YJW9 148 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CORTO00230 105 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 FSTL3O95633 263 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 IGHG3P01860 377 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CECR9P0C854 216 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CT45A6P0DMU7 189 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CT45A5P0DMU8 189 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CT45A7P0DMV0 189 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 IGLL1P15814 213 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 TSPOP30536 169 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 FABP6P51161 128 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 RBX1P62877 108 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 EDDM3AQ14507 147 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 PMCHL1Q16048 86 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 RTL8BQ17RB0 113 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 PRR14LQ5THK1 2151 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 STUMQ69YW2 141 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 PATE2Q6UY27 113 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZN92 141 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZT83 130 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 ATOH7Q8N100 152 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 UNC80Q8N2C7 3258 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 MUC15Q8N387 334 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 KIR3DL3Q8N743 410 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 NUP35Q8NFH5 326 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 OR4S2Q8NH73 311 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 OR9G1Q8NH87 305 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 LEAP2Q969E1 77 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 ADTRPQ96IZ2 230 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 TXN2Q99757 166 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 SLC25A2Q9BXI2 301 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 COMMD5Q9GZQ3 224 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 LINC00574Q9H8X3 128 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 ENY2Q9NPA8 101 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 ASCL3Q9NQ33 180 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 BET1LQ9NYM9 111 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CALYQ9NYX4 217 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 PRNDQ9UKY0 176 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 FZR1Q9UM11 496 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 OR51B2Q9Y5P1 312 aa2.55□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 CA1P00915 261 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
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PTPRK-202ENST00000368205 NTF3P20783 257 aa2.54□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 MYCNOSP40205 109 aa2.54□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 CDKN1BP46527 198 aa2.54□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 REG1BP48304 166 aa2.54□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 GNG10P50151 68 aa2.54□□□□□ -2
PTPRK-202ENST00000368205 MFAP2P55001 183 aa2.54□□□□□ -2
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