RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM218A2RU14 115 aa14.96□□□□□ -0.01
CCDC71-201ENST00000321895 GGTLC3B5MD39 225 aa14.96□□□□□ -0.01
CCDC71-201ENST00000321895 H3BTX0 84 aa14.96□□□□□ -0.01
CCDC71-201ENST00000321895 PDE6DO43924 150 aa14.96□□□□□ -0.01
CCDC71-201ENST00000321895 MEOX2P50222 304 aa14.96□□□□□ -0.01
CCDC71-201ENST00000321895 RANP62826 216 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCDC71-201ENST00000321895 HELTA6NFD8 242 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF785A8K8V0 405 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM250H0YL14 139 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF253O75346 499 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 NDUFB4O95168 129 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SFTA3P0C7M3 94 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 EDN2P20800 178 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 CBLN1P23435 193 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 MYCNOSP40205 109 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 C17orf77Q96MU5 243 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 CITED1Q99966 193 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 F6UZH7 168 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 Q9H3A6 140 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 M0QZ24 198 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 FOLR2P14207 255 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 OTORQ9NRC9 128 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SLC17A3O00476 420 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 PSG9Q00887 426 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 S100A1P23297 94 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 PGPA6NDG6 321 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 OVOL1O14753 267 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 C11orf52Q96A22 123 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 LINC00052Q96N35 136 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 CEBPGP53567 150 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 TCF24Q7RTU0 167 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SEC11CQ9BY50 192 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 CSN3P07498 182 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 NRN1Q9NPD7 142 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 F8W036 122 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 ADCYAP1P18509 176 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 MLXQ9UH92 298 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC71-201ENST00000321895 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 EPDR1Q9UM22 224 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 PF4P02776 101 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 PARLQ9H300 379 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 PEX7O00628 323 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 ATG101Q9BSB4 218 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF747Q9BV97 191 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 PRELID1Q9Y255 219 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 SOCS3O14543 225 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 GNG5P63218 68 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 C16orf92Q96LL3 132 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 TCRAP04437 139 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 CSN1S1P47710 185 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 DERL1Q9BUN8 251 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF727A8MUV8 499 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 M0R3E3 92 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 ISLRO14498 428 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 AKR1C3P42330 323 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 DCANP1Q8TF63 244 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC71-201ENST00000321895 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms