RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 MC5RP33032 325 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 LGALS7P47929 136 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 CRIP1P50238 77 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 PAX8Q06710 450 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 FA2HQ7L5A8 372 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.72□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 GAGE10A6NGK3 116 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 TNFRSF1AP19438 455 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 CCL8P80075 99 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 Q6AWC8 147 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 U3KQK5 164 aa6.71□□□□□ -1.33
UBQLN3-201ENST00000311659 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 TEX22C9J3V5 150 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 K7EP34 96 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 CD40P25942 277 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 LYZP61626 148 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 NUP37Q8NFH4 326 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.71□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 A6NDN8 102 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 J3KRW8 73 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 SIVA1O15304 175 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 APELAP0DMC3 54 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 CNTFRP26992 372 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 UQCRFS1P47985 274 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 ASCL2Q99929 193 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 G3V4G9 280 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 I3L2K1 104 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 RBPJQ06330 500 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 HSD52Q0P140 79 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PSG3Q16557 428 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 C17orf77Q96MU5 243 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 NGBQ9NPG2 151 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 CTSZQ9UBR2 303 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PSG8Q9UQ74 426 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.7□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 CACNA1BQ00975 2339 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 C17orf100A8MU93 164 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 D6R8Y8 96 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM178BH3BS89 294 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 H3BUT2 72 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 IGKV1-17P01599 117 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 KIR3DS1Q14943 382 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PRORYQ9H606 182 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 ZZEF1O43149 2961 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 A0A0G2JLM5 398 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 H3BRN7 92 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 CEACAM3P40198 252 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 CACNG7P62955 275 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.69□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 A1L4Q6 167 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 NDUFB3O43676 98 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM27E3Q08E93 113 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 ADIPOQQ15848 244 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 GFRALQ6UXV0 394 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 PRELID3AQ96N28 172 aa6.68□□□□□ -1.34
UBQLN3-201ENST00000311659 THYN1Q9P016 225 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms