RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.8□□□□□ -0.52
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM189A5PLL7 270 aa11.8□□□□□ -0.52
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB123Q8N688 67 aa11.77□□□□□ -0.53
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.75□□□□□ -0.53
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C7orf69Q9H7B7 122 aa11.75□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PPI3 338 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.74□□□□□ -0.53
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF7Q9UBF6 113 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADAMTS20P59510 1910 aa11.74□□□□□ -0.53
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.74□□□□□ -0.53
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.74□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 J3KRW8 73 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 MC5RP33032 325 aa11.73□□□□□ -0.53
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 GLMPQ8WWB7 406 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 RITA1Q96K30 269 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 DSCAMO60469 2012 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZT83 130 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTH2Q96A98 100 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.73□□□□□ -0.53
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