RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 MORN5Q5VZ52 161 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 G3V4G9 280 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 SPXQ9BT56 116 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 PLXNB2O15031 1838 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 SRRM5B3KS81 715 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 TMEM126AQ9H061 195 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 MRAPQ8TCY5 172 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.04□□□□□ -0.32
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CTIF-201ENST00000256413 ZNF747Q9BV97 191 aa13.03□□□□□ -0.32
CTIF-201ENST00000256413 C17orf100A8MU93 164 aa13.03□□□□□ -0.32
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CTIF-201ENST00000256413 IGKV1D-39P04432 117 aa13.02□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 CD177Q8N6Q3 437 aa13.02□□□□□ -0.33
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CTIF-201ENST00000256413 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.01□□□□□ -0.33
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CTIF-201ENST00000256413 H0YJW9 148 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 TIMM23O14925 209 aa13□□□□□ -0.33
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CTIF-201ENST00000256413 PARP14Q460N5 1801 aa13□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 E9PLN8 166 aa13□□□□□ -0.33
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CTIF-201ENST00000256413 ZNF318Q5VUA4 2279 aa12.99□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.99□□□□□ -0.33
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CTIF-201ENST00000256413 POU2AF1Q16633 256 aa12.98□□□□□ -0.33
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CTIF-201ENST00000256413 GGNQ86UU5 652 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 DSCR9P59020 149 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 TMEM14BQ9NUH8 114 aa12.97□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 J3KT08 172 aa12.96□□□□□ -0.33
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CTIF-201ENST00000256413 BSPH1Q075Z2 132 aa12.96□□□□□ -0.33
CTIF-201ENST00000256413 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 Q8NFD4 153 aa12.96□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa12.96□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 C9orf106Q8NAJ2 232 aa12.96□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 UBL5Q9BZL1 73 aa12.95□□□□□ -0.34
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