RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640039.1

SPIN3-233, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,067 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-233	ENST00000640039	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PSMB3	P49720	205 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	B2M	P61769	119 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	FGL1	Q08830	312 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	OPCML	Q14982	345 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PFDN5	Q99471	154 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	ISLR	O14498	428 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039		Q6ZWC4	215 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	ATP5S	Q99766	215 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	LYL1	P12980	280 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PRR20E	P86478	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PRR20C	P86479	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PRR20D	P86480	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PRR20B	P86481	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	PRR20A	P86496	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	DEFB135	Q30KP9	77 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	SOCS3	O14543	225 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	IFNA5	P01569	189 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	SPRY2	O43597	315 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	SPP1	P10451	314 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-233	ENST00000640039	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	AGRN	O00468	2067 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039		A0A087X0K7	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	RNF183	Q96D59	192 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039		H3BMM0	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	CXCL2	P19875	107 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF738	Q8NE65	137 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	C20orf173	Q96LM9	149 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	DEFB1	P60022	68 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	ZNF266	Q14584	549 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039		Q5BKY6	102 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	MUC7	Q8TAX7	377 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.59	□□□□□ -0.55
SPIN3-233	ENST00000640039	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55

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