RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	CFC1	P0CG37	223 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	S100G	P29377	79 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SULT1A1	P50225	295 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SULT1A2	P50226	295 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8IYB0	196 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RDH5	Q92781	318 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM243	Q9BU79	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	GLS2	Q9UI32	602 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPN13	Q12923	2485 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ITPR2	Q14571	2701 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA4	P78363	2273 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR31	O00270	319 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DEDD	O75618	318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	REG1B	P48304	166 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG7	Q13046	419 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8G1	Q15617	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNS1	Q96KK3	526 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00052	Q96N35	136 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DUX3	Q96PT4	197 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FBN2	P35556	2912 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CAD	P27708	2225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCE1	Q9P212	2302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BP45	60 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SCO1	O75880	301 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CDS2	O95674	445 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	GLRX	P35754	106 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMB2	P49721	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6P435	159 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NPB	Q8NG41	125 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM8	Q96KF7	97 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TP53RK	Q96S44	253 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SPIN2A	Q99865	258 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DPRX	A6NFQ7	191 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2H2	O95918	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CA2	P00918	260 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	APOC3	P02656	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CECR9	P0C854	216 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MPV17	P39210	176 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HERVK_113	P61574	105 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DRB3	P79483	266 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZTC4	211 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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