RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	PLP1	P60201	277 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152		P01737	135 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	PRNT	Q86SH4	94 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	MLST8	Q9BVC4	326 aa		10.36	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	IL4	P05112	153 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	CFHR4	Q92496	578 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	TOMM40	O96008	361 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	LTA	P01374	205 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	RNF5	Q99942	180 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	VPS13C	Q709C8	3753 aa		10.35	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM3	P40198	252 aa		10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	GTSF1	Q8WW33	167 aa		10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	VAMP8	Q9BV40	100 aa		10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00614	P0C842	121 aa		10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPR1	153 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	TCF21	O43680	179 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	COL8A1	P27658	744 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	UCN	P55089	124 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	GNG7	O60262	68 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	PRTN3	P24158	256 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	GAGE1	Q13065	139 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	LY6D	Q14210	128 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	RNF125	Q96EQ8	232 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.33	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	NDP	Q00604	133 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	PAX2	Q02962	417 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		A8MWL6	223 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		M0R3E3	92 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		Q86TA4	180 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	NIT1	Q86X76	327 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		M0QZ24	198 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	HSBP1	O75506	76 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	RASL11A	Q6T310	242 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ATOH7	Q8N100	152 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		10.32	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ODF3B	A8MYP8	253 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf79	P0CE67	100 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	TFPI2	P48307	235 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	HBB	P68871	147 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		Q56UQ5	140 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		M0R1W7	72 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFA3	O95167	84 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		Q8N976	141 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	NPB	Q8NG41	125 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM12	Q96EX1	92 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.31	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GXF2	115 aa		10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		H3BRN7	92 aa		10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76

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