RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE12JA6NER3 117 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 KNCNA6PVL3 124 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM238C9JI98 176 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 APOC4P55056 127 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE1Q13065 139 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE4Q13068 117 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE5Q13069 117 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RTTNQ86VV8 2226 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 D6R8Y8 96 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WV48 116 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 VWC2LB2RUY7 222 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LEPROTO15243 131 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 MDS2Q8NDY4 140 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 OSTCQ9NRP0 149 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PATJQ8NI35 1801 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 VCYO14598 125 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 DKK1O94907 266 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RNF5Q99942 180 aa7.08□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0A6YYD4 124 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GATA3P23771 443 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZS92 163 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TSKUQ8WUA8 353 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 VSIRQ9H7M9 311 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF114Q8NC26 417 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A096LPF7 62 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PAX9P55771 341 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TREML4Q6UXN2 200 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 CRYGSP22914 178 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1D-12P01611 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TRGV9Q99603 122 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SPXQ9BT56 116 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 EFNA2O43921 213 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE7O76087 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE12FP0CL80 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE12GP0CL81 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE12IP0CL82 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SLAQ13239 276 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MWV9 139 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SEC11AP67812 179 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PYY3Q5JQD4 70 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 AZU1P20160 251 aa7.06□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BKO60814 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV1-69P01742 117 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BJP06899 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BOP23527 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BBP33778 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BDP58876 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BCP62807 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PSG3Q16557 428 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 MST1LQ2TV78 715 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 B5MCH6 92 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP6V0E1O15342 81 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RASL11AQ6T310 242 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 MGST2Q99735 147 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PSME4Q14997 1843 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 C22orf46C9J442 243 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 THAP8Q8NA92 274 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 CACNA1GO43497 2377 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms