RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612263.1

WHAMMP3-202, Transcript of WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules pseudogene 3, humanhuman

TSL 4

Gene WHAMMP3, Length 538 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3-202ENST00000612263 PATE2Q6UY27 113 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PRR15Q8IV56 129 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PXT1Q8NFP0 134 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 Q8TAT8 98 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 UCK1Q9HA47 277 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 VPS29Q9UBQ0 182 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 U3KQA8 63 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 MUC17Q685J3 4493 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 NCOA1Q15788 1441 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ZANQ9Y493 2812 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 KNTC1P50748 2209 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LAMA3Q16787 3333 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 A0A087WTM6 91 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 NUPR2A6NF83 97 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 C10orf142B7Z368 130 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 IFNA5P01569 189 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CD2P06729 351 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TPM3P06753 285 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FREM3P0C091 2139 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAM236CP0DP71 79 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 IFITM1P13164 125 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SRIP30626 198 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FXYD6P3P58550 94 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LYG2Q86SG7 212 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PRADC1Q9BSG0 188 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LIMD2Q9BT23 127 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 KIFC1Q9BW19 673 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 MED29Q9NX70 200 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LOC285556D6RIA3 1793 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CPDO75976 1380 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RYR1P21817 5038 aa-0.33□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PTPRMP28827 1452 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 VWFP04275 2813 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 C1orf196B1AJZ1 125 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PIK3C2GO75747 1445 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PIAS1O75925 651 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SOGA1O94964 1423 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ZFYVE9O95405 1425 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SERPINA6P08185 405 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CD14P08571 375 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PDE6GP18545 87 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SPRR2EP22531 72 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SPRR2AP35326 72 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 OR6V1Q8N148 313 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CFAP53Q96M91 514 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCL19Q99731 98 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LINC00467Q9BRT7 94 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TMEM126AQ9H061 195 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TAF9BQ9HBM6 251 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PTPRFP10586 1907 aa-0.34□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.35□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CEP164Q9UPV0 1460 aa-0.35□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 MGAMO43451 1857 aa-0.35□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 CD109Q6YHK3 1445 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 NUP98P52948 1817 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 A0A0J9YY99 117 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 SMIM9A6NGZ8 99 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 E7EUB6 86 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 C5orf67F2Z3F1 127 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 J3QRK9 145 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 IFNA16P05015 189 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 RHOBP62745 196 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 RANP62826 216 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 CDKL4Q5MAI5 379 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 C1orf134Q5TEV5 83 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 LINC00269Q8N2A0 174 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 CT55Q8WUE5 264 aa-0.35□□□□□ -2.47
WHAMMP3-202ENST00000612263 C8orf76Q96K31 380 aa-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms